Manual de utilização do ambiente de processamento paralelo do LAD

O presente documento tem como objetivo orientar e instruir os usuários do Laboratório de Alto Desempenho da PUCRS, do PUCRS Ideia, sobre a utilização do laboratório.
Em caso de dúvidas, pode entrar em contato via e-mail: contato.lad@pucrs.br ou suporte.lad@pucrs.br.

5. Aplicações

As aplicações disponíveis nos clusters podem variar para cada conjunto, mas o caminho para o diretório em que estão localizadas é o mesmo. No exemplo abaixo podemos ver algumas aplicações que estão disponíveis no cluster Pantanal:

user@pantanal:~$ ls /LADAPPs 

BBTools      GTDB-Tk         Paleomix    TensorFlow

CheckM       HMMER         PyRadiomics   XGBoost

fastANI  Intel_Cluster_Studio_XE_2017  qiime      RevBayes

GATE        Java          mOTUlizer

Geant4       OpenMPI        SciKit-Learn


As aplicações localizadas nesse diretório são instaladas pelos administradores do LAD. O usuário pode instalar aplicações que deseje no seu diretório “/home/”, sendo possível também solicitar a instalação de alguma aplicação contatando o suporte do LAD por email.

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