Equipamentos do LAD
Conheça as propriedades e aplicações dos nossos clusters, lembrando que para pedir viabilidade de instalar algum outro aplicativo que não esteja na lista basta enviar email ao suporte.lad@pucrs.br que analisaremos a viabilidade.
Amazonia
- Nós: 4
- Núcleos: 160
- Memória RAM: 880 GB
- Rede: 4 redes 10 Gigabit Ethernet
Aplicações instaladas
- Intel Cluster Studio XE 2017
- OpenMPI
- antiSMASH
- R
Descrição: Cluster recomendado para processamentos que exigem muita memória em uma única máquina
Cerrado
- Nós: 28
- Núcleos: 672
- Memória RAM: 688 GB
- Rede: 2 redes Gigabit Ethernet e 1 rede InfiniBand QDR 4x (32 Gbit/s)
Aplicações instaladas
- Intel Cluster Studio XE 2017
- OpenMPI
- antiSMASH
- LAMMPS
- Paleomix
Descrição: Ideal para aplicações paralelas (MPI) que precisam de comunicação entre vários nós.
Atlantica
- Nós: 16
- Núcleos: 256
- Memória RAM: 256 GB
- Rede: 4 redes Gigabit
Aplicações instaladas
- Intel Cluster Studio XE 2017
- OpenMPI
- Go
- OpenCV
Descrição: Possui muitas máquinas, sendo uma boa opção para aplicações paralelas (MPI) que precisam de comunicação entre vários nós.
Pantanal
9 nós · 752 núcleos · 3136 GB de RAM · 4 redes gigabit ·
- 5 nós: GPUs Nvidia M40 12 GB (3 no total)
- 4 nós: mais memória RAM e GPUs Nvidia L40 48 GB (16 no total)
Aplicações instaladas (58)
- R
- Intel Cluster Studio XE 2017
- OpenMPI
- antiSMASH
- BBTools
- BiG-SLiCE
- CheckM
- Cutadapt
- Darknet
- FSL
- FastQC
- FreeSurfer
- GATE
- GCC
- GTDB-Tk
- Geant4
- Gromacs
- HMMER
- HyPhy
- IQ-TREE
- Java
- JuliaLang
- Kaiju
- LAMMPS
- MPAC
- MSBooster
- MSFragger
- Maven
- Megahit
- MetaPhlAn+HUMAnN
- Minimap2
- NCBI-Blast
- ORCA
- OpenFOAM
- PIMBA
- Paleomix
- PyRadiomics
- PyTorch
- Quast
- RevBayes
- SPAdes
- SRA-Toolkit
- STAR
- STIR
- SciKit-Learn
- SqueezeMeta
- StringTie
- Subread
- TNT
- TensorFlow
- Trimmomatic
- VVCSoftware_VTM
- VVenC
- XGBoost
- YOLOv5
- fastANI
- mOTUlizer
- qiime
- samtools
- snpArcher
Descrição: Cluster de maior utilização no LAD, com o maior catálogo de aplicações disponíveis entre os clusters. Também conta com Docker, mas seu uso é restrito a usuários autorizados.
Para solicitar acesso ao Docker, envie um e-mail para suporte.lad@pucrs.br informando seu usuário no LAD.
Cdia
- Nós: 2
- Núcleos: 48
- Memória RAM: 256 GB
- GPU: 2x Nvidia RTX A5000 24 GB GDDR6 ECC
Aplicações instaladas
- Intel Cluster Studio XE 2017
- OpenMPI
Descrição: Execução de aplicações próprias dos usuários, com foco em IA e paralelismo geralmente o usuário traz sua aplicação ou modelo para treinar, sem depender de um catálogo grande de aplicações já pré-instaladas.
Nimbus
- Equipamentos: 23
- Armazenamento: 363,8 TB
- Núcleos: 360
- Memória RAM: 576 GB
- Rede: heterogênea, de Gigabit Ethernet a 10 Gigabit Ethernet
Descrição: Hospeda máquinas virtuais, armazenamento e serviços do laboratório que precisam ficar disponíveis continuamente (24x7), não é destinado à submissão de jobs de processamento.